游戏还增加了新的口袋普通副本关卡，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的妖怪养成闪光精灵系统，增加宠物联赛中道具掉落概率。精灵开放了极限竞技场，对战原始固多拉，手游便宜独立服务器租用游戏中，口袋广州低价物理机优化了十连抽，妖怪养成增加了表情包，精灵Mega大嘴娃，对战闪光变异后精灵外观变色，手游炎帝，口袋妖怪养成 降低了融合所需要的精灵经验，并提高个体值，对战为每一只精灵量身打造了唯一的手游技能释放特效，降低了角色30级之前升级所需经验，游戏中，完美还原了宿命对决，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。原始盖欧卡，雷神，完美复刻了3DS平台的游戏体验，超过700只超强小精灵，新增了Mega巨钳螳螂，水君等新精灵。Mega暴鲤龙，联合进化等功能。开放了精灵闪光功能，10连抽内可能出现精灵碎片，野外神兽捕捉，高度还原了全部六世代，在对战中完美表现出了属性相克，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，3V3极限竞技带来更多的战术变化，增加了城内交互系统，并增加通用碎片，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，优化了聊天栏，忠实还原十八种原作属性。